Více než tři sta let se v obci střídalo místo, kde se vyučovalo. Žádné však nevyhovovalo potřebám školy na počátku 20. století. Proto dne 30. června 1903 bylo započato na místě bývalých "masných krámů" se stavbou nové školní budovy na náměstí. Masné krámy byly zbourány a stavba sama trvala pouhých 14 měsíců, po jejímž dokončení vznikla na kunžackém náměstí na svoji dobu velmi moderní budova. Byla vybavena iústředním topením.
     Stavbyvedoucím byl Eduard Noll, stavbu prováděla firma stavitele J. Šonského z Jindřichova Hradce. Budova školy byla v majetku obce, stejně jako školní zahrada o výměře 10 arů. Škola byla postavena nákladem 155 000 Kč a na celý náklad byla učiněna zápůjčka u Zemské banky v Praze (120 000 Kč) a u Ústřední banky českých spořitelen (35 000 Kč) na dobu 75 let při 4% úrokování. (Stav zápůjčky v roce 1939 byl celkem 104  459,07 Kč.) Kolaudace budovy proběhla 24. srpna 1904, prohlédla ji c.k. komise a uznala ji vhodnou k vyučování.
     V kronice školy se o této události dočteme: "Po mnohém strádání žáků i učitelů v místnostech, které snad někdy vyhovovaly, ale během doby se úplně nezpůsobilými k účelu svému, po nekonečných odkladech, vystavěla konečně obec slušnou budovu pro školy obecné a měšťanské. Slavnostní svěcení dne 11. září 1904 dála se způsobem nehlučným, však důstojným, za velké účasti zástupců úřadů zemských, autonomních, školských i církevních. Budova byla zvenčí vyzdobena prapory, uvnitř pak vyzdobena byla kreslírna a ve sborovně byl okrášlen obraz Našeho Nejmilostivějšího Císaře a Krále Františka Josefa I. Krátce po druhé hodině odpolední sešla se skvělá reprezentace před radnicí a odsud v čele školních dítek odebrala se do chrámu Páně k odpoledním slavným službám Božím. Po slavných službách Božích v průvodu školní mládeže a asistenta kněžstva odebrala se před novou budovu školní. Zde vykonán veledůstojným pánem P. Šimonem Kabátem, vikářem zdejším, obřad svěcení budovy školní zvenčí a za mohutného chorálu "Svatý Václave" nakropena cesta dovnitř budovy. V kreslírně konány další církevní obřady, posvěceny kříže a jednotlivé síně učební."
     Nová školní budova se však v dalších letech nevyhla některým opravám.V roce 1910 místo ústředního topení, které plně nevyhovovalo, byly všechny místnosti vybaveny kamny a postaveny tři nové komíny. Úprava stála 1200 K, ale oprava ústředního topení by bývala stála 8000 K. Kromě toho v dalších dvou desetiletích bylo zřízeno zábradlí ve vestibulu po obou stranách schodiště, v tělocvičně udělána nová podlaha a položeny parkety, provedena oprava fasády a v roce 1925 všechna okna opatřena záclonami. V roce 1933 bylo v tělocvičně zřízeno elektrické větrání a současně také zlepšeno elektrické osvětlení.
     Generální oprava měla proběhnout již v roce 1934, ale protože starosta Bedřich Fiala rezignoval, tak byla přesunuta na rok 1935 a obec na ni vyčlenila částku 40 000 Kč. Po ustanovení přípravného komitétu se začalo s přípravami. Bylo rozhodnuto, že obec povede vše ve své režii, stavitel bude vykonávat jen technický dozor. Písek na stavbu se bral z kunžackých potoků, prvně u brodu a potom ve Struhách. Dílovedoucím byl pan Jan Průl, na stavbě pracovalo 8 zedníků, 1 lešenář, 11 dělníků od 17. června do 10. srpna, po celých 44 dnů žádný déšť nepřerušil práci ani na hodinu. Barva fasády byla vybrána zelená ve dvou odstínech, světlejší byl použit na vystupující části. Kromě opravy fasády byla ve všech místnostech také opravena a natřena okna, římsy a žlaby. Na střeše byly vyměněny poškozené tašky. Opravě se nevyhnuly ani školní hodiny, ciferník byl opatřen žárovkou, aby v noci byl osvětlen a každý dobře viděl, kolik je hodin. Po celé budově byl rozveden školní telefon. Práce zednické, truhlářské, natěračské, klempířské, pokrývačské provedli místní řemeslníci a materiál byl také zakoupen u místních obchodníků. Nakonec celá oprava přišla na 38 866,40 Kč.
     Po skončení druhé světové války, kdy na jaře 1945 škola sloužila po dobu 7 týdnů jako ubytovna pro německé uprchlíky, musely být provedeny opravy, neboť byla například vytlučena skoro všechna okna. V roce 1946 byl do školy zaveden státní telefon, v roce 1949 školní rozhlas do všech tříd.
     V padesátých letech byly odstraněny nevyhovující záchodky a nahrazeny splachovacími, zaveden vodovod do školy, umyvadly s tekoucí vodou byla vybavena sborovna, ředitelna, školníkův byt, kreslírna a záchody. Přistavěly se dvě školní šatny. Zlepšilo se osvětlení ve třídách a byla zavedena elektřina do kabinetů.
     Počátkem sedmdesátých let proběhla rekonstrukce podlahy tělocvičny a byl zbudován sklep, který v budoucnu bude sloužit jako kotelna ústředního topení. Postavila se kotelna a zavedlo ústřední topení. Mnohé práce byly provedeny brigádnicky, pomáhali zejména rodiče žáků.
     V roce 1978 bylo započato s celkovou opravou školy, během níž došlo k výměně oken, dveří, dlažby na chodbách, rekonstrukci elektroinstalace, odpadní instalace, stropu v tělocvičně a šaten, zavedení vodovodu do všech tříd, přeložení střešní krytiny, opravě fasády. Opravy probíhaly až do léta 1982, přičemž se pracovalo nejen o prázdninách, ale i během školního roku, bylo tedy nutno vyučovat i v družině, školní jídelně, v zasedací síni MNV. Stavbu prováděl Okresní stavební podnik. Při úklidu pomáhali rodiče, odpracovali přes 500 hodin. Škola byla vybavena novým nábytkem a začala sloužit odborná učebna fyziky a chemie.
     Počet tříd však stále rostl a všechny se nevešly do budovy školy. A tak byly 1. a 2. třídy umístěny v pavilonu mateřské školy. V devadesátých letech škola nevyhovovala nejen malou kapacitou, ale i v mnoha jiných parametrech. Nejrozsáhlejší rekonstrukce v dějinách budovy základní školy byla zahájena v roce 1995. Část finačních prostředků Obec získala ze státní dotace a na zbytek si vzala úvěr. Celkové náklady na tuto první část oprav činily téměř 13 milionů korun a na dovybavení budovy nábytkem 580 000 Kč. Projekt na dostavbu vypracoval P-Ateliér Jindřichův Hradec a stavbu prováděla firma Stavcent a. s. Jindřichův Hradec. Stavba byla zahájena v říjnu a probíhala během celého školního roku, práce vrcholily o prázdninách 1996. V nástavbě na místě bývalé půdy bylo vybudováno 5 nových učeben, 3 kabinety, cvičná kuchyně, sklad učebnic. Dále byly opraveny dva kabinety a 1 učebna v 1. poschodí a záchody ve všech patrech. Škola byla vybavena výtahem a stala se tak bezbariérovou. Také došlo ke změně v dalších podlažích, kde byla vybudována respiria, celá budova se tím prosvětlila, přestavbou byly odstraněny dřívější prostory, kde byly šatny. Byly zakoupeny šatnové skříňky, které jsou umístěny v přízemí. Pod respirii v suterénu vznikly další dvě místnosti, v jedné je umístěna dílna školníka a v druhé kancelář vedoucí školní jídelny. Byl obnoven původní větrací systém. Do okapů na severní straně byl umístěn vyhřívací kabel proti jejich zimnímu zamrzání. Byla opravena fasáda celé budovy. Na vybavení nových učeben pomůckami uvolnil Školský úřad 140 000Kč. Stavba byla dokončena i díky sponzorským příspěvkům (Prama Kardašova Řečice, Strabag Bohemia, Jednota Jindřichův Hradec, Lesy Český Rudolec, Obec Střížovice, Obec Člunek, Sunny Side, Česká spořitelna a.s. České Budějovice, Obal Rozkoš) a pomoci rodičů při úklidu, aby mohl být včas zahájen nový školní rok. Nové učebny byly vybaveny novým nábytkem, ale i do některých dalších učeben byl dán rekonstruovaný nábytek. Byly zakoupeny nové pomůcky, zřízena počítačová učebna. Další dotaci na zakoupení nových pomůcek ve výši 530 000 Kč získala škola v září 1997.
     Od června do října 1998 probíhaly ve škole další stavební úpravy. Jednalo se o dvě rozsáhlé akce - plynofikaci kotelny ústředního vytápění a rekonstrukci školní kuchyně, jídelny a šesti místností v přízemí. Projekt na obě akce zpracoval opět P-Ateliér Jindřichův Hradec. V červnu zahájila práce stavební firma Staviservis demontáží zařízení původní kotelny na tuhá paliva. Byly rozebrány všechny tři staré kotle, ohřívač vody, veškeré rozvody a regulační zařízení. Podlaha kotelny byla zvýšena asi o 1,5 m a v suterénu budovy v úrovni podlahy vybudován topný kanál pro rozvod tepla a teplé vody. V místě bývalé kotelny byly zbudovány nová plynová kotelna, plynoměrna, příruční sklad materiálu. V kotelně byl instalován plynový kotel Viessmann a plynový ohřívač vody. Kolaudace se konala v září 1998. Náklady činily 1 300 000 Kč, 1 milion byl ze státní dotace.
     Výstavbou plynové kotelny se uvolnil prostor bývalých uhelen pro realizaci projektu na rozšíření školní kuchyně a jídelny, která má svou vlastní historii.
     Školní stravovna byla zřízena v roce 1951 na náměstí v domě čp. 92. Do stravovny bylo zakoupeno nádobí, sporák opatřil ředitel v Nové Bystřici, stoly zapůjčilo ředitelství Gymnázia v Jindřichově Hradci. Byla otevřena 1. listopadu, průměrně se zde stravovalo 60 dětí, kromě obědů se podávaly dětem dopoledne i odpoledne svačiny. Za oběd děti platily 7 Kč a za svačinu 2 Kč. Například ve školním roce 1952/53 se vařilo 90 obědů a svačin denně.V roce 1957 se školní jídelna přestěhovala do suterénu budovy školy. V roce 1982 - ve školní jídelně se stravuje 269 žáků a 27 dospělých, kuchařky pracují na 18 m², plocha jídelny je 55 m², na jednom místě se během oběda musí vystřídat 5 - 6 strávníků!
     Tento nevyhovující stav se podařilo vyřešit až touto přestavbou v roce 1998. Školní jídelna i kuchyně doznaly značných změn. Zvětšila se kapacita školní jídelny na 72 míst, byla vybavena teplovzdušným vytápěním, novým nábytkem. Rozšířil se prostor kuchyně, přípravny a skladů. Vybavení bylo zmodernizováno, přibyla nová myčka nádobí, fritéza, plynový sporák, ohřívače talířů, výhřevné výdejové pulty, elektrické trouby, stoličky na přihřívání. Pro zlepšení pracovního prostředí byla instalována výkonná vzduchotechnika. Kolaudace proběhla na konci října. Vařit se začalo v pondělí 2. listopadu 1998.
     Stavba prováděná firmou Stavcent a. s. Jindřichův Hradec si vyžádala rozsáhlé asanační práce uvnitř školy. V suterénu bylo nutné zbourat stropní klenby a část nosných zdí. Proto se rekonstrukce týkala také 6 místností (4 učebny, sborovna, ředitelna) v přízemí, kde byly nově omítnuty stěny a stropy, provedena rekonstrukce elektrických rozvodů, osvětlení, byly zde položeny nové podlahy a vyměněny radiátory. Kolem budovy byly vybudovány anglické dvorky se zábradlím. Celkové náklady na tuto část rekonstrukce činily 7 milionů Kč.
     V následujícím roce došlo k vydláždění školního dvora, v roce 2001 byla rekonstruována učebna fyziky a chemie, byly zde opraveny omítky, topení, elektřina a připraveny instalace pro rozvody elektřiny a plynu pro vybudování odborné učebny. Dále byl opraven kabinet fyziky a chemie. V obou místnostech byly položeny nové podlahy, kabinet byl vybaven novým nábytkem. Došlo na opravu dveří hlavního vchodu a vnitřní vchodové dveře byly zcela vyměněny, byla zde instalována ústředna na otevírání dveří a další telefonní stanice ve škole. Stavbu prováděla firma Besostav.
     V roce 2002 byla učebna fyziky a chemie vybavena novým nábytkem v hodnotě 300000 Kč a opraveny další dvě třídy v 1. patře. Tuto stavbu realizovala firma Staving Studená.      Bylo zde investováno 500 000 Kč, z toho bylo 150 000 Kč státní dotace. Od září téhož roku začali žáci využívat učebnu informatiky realizovanou v rámci projektu ministerstva školství Internet do škol.
     V červnu 2003 proběhla rekonstrukce poslední učebny v budově školy. Stavbu opět prováděla firma Staving Studená. Další stavební úpravy probíhaly ve školní jídelně. Zásadní rekonstrukce budovy školy započatá v roce 1995 si doposud vyžádala celkové náklady ve výši přes 40 milionů Kč.